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单细胞测序与无菌检验:那艾集菌仪在微生物组学研究中的跨界应用

Q Q:单细胞测序和集菌仪能扯上关系吗?听起来八竿子打不着。
A:有关系——智能集菌仪膜过滤法可以为单细胞测序提供"微生物单细胞富集和分离"的前处理步骤。单细胞微生物组学(Single-Cell Microbial Genomics)需要从一个复杂微生态样本中分离出单个微生物细胞——然后裂解-全基因组扩增(MDA)-测序。分离单个微生物细胞的方法有——显微操作、微流控芯片、荧光激活细胞分选(FACS)等——价格都非常昂贵。一种低成本替代方案——将样本稀释到极低浓度——使每毫升仅含几个到几十个细胞——用集菌仪膜过滤将这几个细胞截留在膜的不同位置——将膜切成小块(每块含0至1个细胞)——各小块分别做裂解和MDA——用测序结果回溯每块上分别是什么菌。那艾仪器NAI-JJY在此应用中作为"低浓度单细胞浓缩和膜面固化"平台。
Q Q:这种用法对集菌培养器有什么特殊要求?
A:低浓度样品对集菌仪的要求甚至比常规无菌检查更高——低浓度意味着管路残留造成的细胞损失在总细胞量中的占比更高——管路残留要从"可接受"变成"最低化"。具体措施——使用低残留泵管(那艾仪器可选配小管径泵管减少管路内壁面积从而减少表面吸附损失)。冲洗体积必须精确——因为膜的切割是基于膜面积等分子块划分的——过滤体积决定膜面上细胞的空间分布——过滤不均匀会导致某些小块分布细胞过多某些过少。NAI-JJY的泵速精度在此应用中显得尤为重要——±2%的流量偏差保证了批次间膜面上细胞分布的一致性。此外还要求严格的管路无菌——因为膜面上任何外源微生物污染都会在后续MDA中被一起扩增并干扰最终结果——NAI-JJY的一次性无菌泵管和培养器确保了从供试液到膜面的全程无菌通路。
Q Q:这个应用的商业化前景如何?
A:目前单细胞微生物组学仍处于学术研究阶段——但这种应用展示了传统无菌检验设备(集菌仪)的技术延展性——当"膜的截留功能"遇到"单细胞分析的精度需求"——旧仪器就能在新领域找到第二曲线。那艾仪器关注这一前沿方向的发展——与国内多家微生物组学研究机构保持技术交流——评估未来将单细胞前处理流程固化到NAI-JJY程序中的可能性。
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