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细菌是最常见的微生物类群，属于原核生物（无成形的细胞核，遗传物质集中在拟核区），单细胞结构，形态多样，主要分为球菌、杆菌、螺旋菌三大类，此外还有弧菌、梭菌等特殊形态。
1. 基本结构：细胞壁（保护细胞、维持形态）、细胞膜（控制物质进出）、拟核（含环状DNA，是遗传物质的主要载体）、细胞质（含核糖体，用于合成蛋白质），部分细菌还具有荚膜（保护细菌，增强抵抗力）、鞭毛（用于运动）、芽孢（细菌的休眠体，耐高温、耐干燥，条件适宜时可萌发为正常细菌）。
2. 营养方式：多数为异养型，需从外界获取有机物作为营养来源；少数为自养型，如蓝细菌（蓝藻）可通过光合作用合成有机物，硝化细菌可通过化能合成作用合成有机物。
3. 繁殖方式：主要为二分裂繁殖，繁殖速度快，部分细菌可通过接合生殖（细菌之间通过性菌毛传递遗传物质）实现基因重组，增强适应性。
4. 常见种类及作用：
有益细菌：乳酸菌（用于制作酸奶、泡菜，分解乳糖产生乳酸，改善食品风味，同时抑制有害菌生长）、双歧杆菌（人体肠道有益菌，调节肠道菌群平衡，促进消化吸收，增强免疫力）、大肠杆菌（正常情况下寄生在人体肠道，帮助合成维生素B族，部分菌株（如O157:H7）为致病菌）、根瘤菌（与豆科植物共生，固定空气中的氮气，转化为植物可吸收的氮素养分，改良土壤）、放线菌（虽单独分类，但与细菌亲缘关系密切，用于生产抗生素，如链霉菌生产链霉素）。
致病细菌：沙门氏菌（常见食源性致病菌，污染肉类、蛋类、乳制品，食用后引发肠胃炎，出现腹痛、腹泻、呕吐等症状）、金黄色葡萄球菌（污染食品后产生毒素，引发食物中毒，还可导致皮肤感染、肺炎等）、幽门螺杆菌（寄生在人体胃黏膜，可引发胃炎、胃溃疡、胃癌等疾病）、结核分枝杆菌（引发肺结核，通过呼吸道传播）、链球菌（引发扁桃体炎、猩红热、风湿热等）。
真菌属于真核生物（有成形的细胞核），分为单细胞真菌（酵母菌）和多细胞真菌（霉菌、大型真菌），细胞结构包括细胞壁（主要成分为几丁质，与植物细胞壁的纤维素不同）、细胞膜、细胞核、细胞质（含多种细胞器，如线粒体、核糖体、内质网等）。
1. 营养方式：均为异养型，无法自身合成有机物，需从外界获取营养，分为腐生（分解动植物遗体、排泄物获取营养，如霉菌、蘑菇）、寄生（寄生在动植物体内，获取营养，如白色念珠菌）、共生（与其他生物共生，如地衣是真菌与藻类的共生体）。
2. 繁殖方式：分为无性繁殖和有性繁殖。无性繁殖包括出芽生殖（酵母菌）、孢子生殖（霉菌、蘑菇，产生孢子，孢子萌发形成新个体）；有性繁殖通过配子结合形成合子，再发育为新个体，增强物种的适应性。
3. 常见种类及作用：
酵母菌：单细胞真菌，呈圆形或椭圆形，常用于食品发酵，如酿酒（分解葡萄糖产生酒精和二氧化碳）、制作面包、馒头（二氧化碳使面团膨胀），同时也是模式生物，用于生物学研究，部分酵母菌（如白色念珠菌）可引发人体感染（如鹅口疮、阴道炎）。
霉菌：多细胞真菌，由菌丝组成（分为营养菌丝和气生菌丝），常见的有青霉菌、曲霉菌、毛霉菌。青霉菌可产生青霉素（第一种抗生素，用于治疗细菌感染）；曲霉菌用于制作酱油、腐乳，部分曲霉菌（如黄曲霉菌）会产生黄曲霉毒素（强致癌物质，污染粮食、油料作物，食用后危害人体健康）；毛霉菌可用于制作腐乳、豆豉，也可能导致食品霉变，引发中毒。
大型真菌：多细胞真菌，子实体可肉眼观察，如蘑菇、香菇、金针菇、木耳等，多为腐生，可食用，富含蛋白质、膳食纤维等营养物质，部分大型真菌（如灵芝、冬虫夏草）具有药用价值，可增强免疫力；少数大型真菌（如毒蘑菇）含有毒素，食用后会引发中毒，甚至危及生命。
病毒是一类无细胞结构的微生物，也是最小的微生物，仅由核酸（DNA或RNA，二者只能有一种）和蛋白质外壳（衣壳）组成，部分病毒还具有包膜（由宿主细胞膜衍生而来）。病毒无法独立完成生命活动，必须寄生在活细胞内，利用宿主细胞的代谢系统进行增殖，离开活细胞后会处于休眠状态，无法繁殖。
1. 结构特点：无细胞壁、细胞膜、细胞核等细胞结构，核心是核酸（遗传物质），外壳是蛋白质，包膜上有糖蛋白，可帮助病毒识别并吸附宿主细胞。
2. 增殖方式：分为吸附、侵入、脱壳、生物合成、组装、释放六个步骤。病毒首先吸附到宿主细胞表面，然后侵入宿主细胞，脱去蛋白质外壳，释放核酸，利用宿主细胞的核糖体、原料等合成病毒的核酸和蛋白质，再组装成新的病毒颗粒，最后释放到宿主细胞外，继续感染其